與臟腑功能失調有關
　中醫認為，便秘的基本病機特點為大腸傳導失常， 氣機不暢，糟粕內停。同時，便秘與肺、脾、胃、肝、腎等臟腑的功能失調密切相關。
飲食熱邪，腸胃積熱
　素體陽盛，或過食辛辣，或過服熱藥而致熱邪內盛； 熱病之後，餘熱留戀，或肺中燥熱下移大腸，均可導致腸胃積熱，耗傷津液，以致腸道乾澀燥結，排便艱澀。患者多見大便乾結，小便短赤，口乾口臭或口舌生瘡，身熱面赤等胃熱薰蒸，充斥上下之證；熱盛於內，腑氣不通，則見腹部脹滿，按之作痛。患者還可見舌紅苔黃燥，脈滑數等腸胃積熱之象。
　此類便秘，臨床辨證為熱秘，治療以清熱潤腸為法， 常用麻仁丸加減。
情志失調，氣機鬱滯
　憂思過度、久坐少動、術後腸道粘連或食偏精細等均可導致大腸氣機鬱滯，通降失常，傳導失職而糟粕內停。患者可見大便不暢、欲便不得，由於津虧熱邪不甚，便質有時並不乾硬。肝氣鬱結、氣機不暢者可見噯氣頻作，脅腹痞滿而痛，症狀隨情志變化而加劇或緩解。若肝鬱日久，脾運受累，則可伴脘脹、納呆等症。
　此類便秘，臨床辨證為氣秘，治療以順氣導滯為法， 常用六磨東加減。
體虛病後，氣血陰虧
　久病、產後及年老體弱之人，氣血虧虛；或過用汗、利、燥熱之劑，損傷陰津；或出汗過多，勞累過度， 耗傷氣血陰精，致氣虛而傳導無力，陰血虧而腸道失於濡潤，糟粕不行，從而造成便秘。
　氣虛者尤以肺脾兩臟為主，肺氣虛而不降，脾氣虛而傳導失職，故雖有便意，但臨廁努掙乏力，便後有疲勞之感。肺虛衛外不固則汗出氣短；脾虛健運無權， 精微不化則神疲氣怯，甚至中氣下陷而見肛門下墜、脫肛等症狀。此類便秘，臨床辨證為氣虛便秘，治療以益氣潤腸為法，常用黃耆東加減。
　血虛者，症見大便秘結如栗或羊屎，面色萎黃無華， 頭暈心悸等。此類便秘，臨床辨證為血虛便秘，治療以養血潤燥為法，常用潤腸丸加減。
　陰虧者，症見口乾少津、五心煩熱；累及腎之陰精者可見腰膝酸軟、頭昏、耳鳴等症。此類便秘，臨床辨證為陰虛便秘，治療以滋陰潤腸通便為法，常用增液東加味。
陽氣虛衰，陰寒凝滯
　嗜食寒涼生冷，或過用苦寒藥物，伐傷陽氣；年老體弱，真陽不足，均可因溫煦無權，不能蒸化津液、溫潤腸道，而致陰寒內結、糟粕不行、凝積腸道。患者多見大便艱澀難出，腹中冷痛喜熱；陽虛溫煦無權則四肢不溫、面色白、腰膝酸冷；氣化無力則小便清長。患者還可見脈來沉遲、舌質淡或淡胖、舌苔白潤而滑等虛寒之象。
　此類便秘，臨床辨證為陽虛便秘，治療以溫陽通便為法，常用濟川煎加味。